胡燕 , 凌巧 , 钟桂娴 , 梁引娣 , 郭建夫 ^* , 章月琴 ^*

广东海洋大学农学院, 湛江, 524088
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2018年12月23日    接受日期: 2018年12月31日    发表日期: 2020年05月20日

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本研究通过对番茄高质量全基因组序列同源搜索分析，找到番茄中共有 13 个 SlGLRs 家族成员。并利用生物信息学方法详细分析了该家族所有成员的基因结构、蛋白结构域、进化关系。结果显示：番茄 SlGLR 家族的 13 个成员均含有 5~7 个外显子，各个成员都包含 IPR001828、IPR001320 和 IPR001638 这三个结构域，整个家族可分为三个亚家族，且 SlGLR II 亚家族各成员，除了 SlGLR2.6 以外均成簇分布在 6 号染色体上。不同激素处理下的表达分析显示该家族不同成员对不同激素处理的响应不同；组织表达分析表明 SlGLR3.2 在番茄的果实中特异高表达，暗示其在果实发育中可能起着重要作用。为了进一步分析其功能，我们对 SlGLR3.2 的理化性质、亲水性/疏水性、跨膜区、亚细胞定位、蛋白二级结构进行了详细分析。结果表明 SlGLR3.2 为亲水性膜蛋白，含有三个跨膜区，二级结构主要由 α- 螺旋、延伸链、β- 转角、无规则卷曲组成。本研究将为进一步研究番茄 SlGLRs 基因家族的功能提供参考依据。
 

番茄(Solanum lycopersicum)；SlGLRs 基因家族； SlGLR3.2； 生物信息学